同年9月，正是甘蔗成熟的季节，一些法律意识淡薄的村民乘机而上，糟蹋甘蔗，形成你偷我抢的不良现象。为及时有效制止这种不法行为，陈元棋主动请缨蹲点值班，为了份外的事废寝忘食地工作着。一天子夜，他发现在通往蔗园的小路上，有2个人抬着偷来的甘蔗缓慢地走着，就立即上前阻止。岂料，其中一人乘机喊来了其他的同伙。无奈他只孤身一人，被歹徒用棒打、刀砍、砖砸，头部多处受伤，虽然经过医生的精心治疗和护理，保住了生命，却留下了终身的残疾，落下了经常头痛、晕厥的毛病。

虽然后来陈元棋因为伤情复发，而不得不离开自己钟爱的保卫工作，但他并没有停止自己见义勇为的步伐，依然怀着那份热忱，在他人面对死神和灾难威胁时挺身而出。

1999年12月21日傍晚，同村村民陈元来（复员军人）一家外出劳作，家中却因草木灰自燃，引发火灾。在家煎药的陈元棋看到村东上空浓烟滚滚，意识到是发生了火灾，就立即喊上自己的妻子及孩子，带上竹梯及水桶去救火。面对熊熊的烈火，陈元棋奋不顾身，一面呼喊乡亲们一起支援，一面冲进室内就近灭火。因烟雾熏眼，他误跨烧透的木材堆上，导致下榻，经挣扎翻滚，带着火苗撬门窜出，其头发烧焦，手、脚及躯体部分也被烈火灼伤。但他不顾摔伤、烧伤，依旧不下火线，继续带领群众救火。一直到烈火被扑灭，他才在妻子的搀扶下回家。由于烧灼伤，他经过了六星期的治疗才得以康复。当他得知陈元来经火灾烧了木料家财以至无力重建时，他又与妻子把自己欲建房的一些建筑材料无偿运载到陈元来家，还出工掏钱帮助其恢复原貌，经过十余天的劳动，直至工程完善才回家。