哈根斯出生在波兰西部。他从小就患有血友病，曾经住院近一年。他后来表示，那段时间自己孤独无助，但天天目睹医生和护士的工作，令他想成为一名医生。14岁的时候，哈根斯在叔叔的农场里解剖了一头小牛。