在恢复延安后，三桂统兵迅速攻取了延绥镇城，击败农民军余部，斩首4 600余级。陕西巡抚黄尔性请求速派地方官员到任，治理地方。《清世祖实录》，卷43，12～13页。

　　收到恢复延绥镇的捷报仅仅几天，已是八月初，三桂又送上新的战报：他与李国翰又率部自西安北上，在蒲城(陕西蒲城)与南下的榆林叛军相遇，杀伤相当。至中午，三桂率铁骑数百，冒矢石冲锋陷阵，榆林兵败退。克蒲城后，乘胜继续北上追击，连克宜君(陕西宜君)、安塞(陕西安塞南)、清涧(陕西清涧)诸镇，歼灭数千人《清世祖实录》，卷45，8页；参见《庭闻录》，卷2。，兵锋直指榆林。

　　到了这年冬，在其他一些地区，陕西与四川交界处，两省的农民军欲会合，逼向陕西。当地驻守清兵迎战，把他们击败。《清世祖实录》，卷46，19页。在陕西西南部，邻近河南的龙驹寨(今丹凤)，已被农民军占领，商雒道(指商州、雒南地区)清兵破其地，阵斩其首领雷登高。《清世祖实录》，卷46，28页。但大规模的战斗是在陕西北部、长城脚下的榆林地区展开的。由刘登楼、任一贵、谢汝德等率领，集中了大批农民军，坚守榆林。三桂率部直逼城下，猛攻数日，农民军支撑不住，溃奔榆林西协定边一带。三桂配合作战，发兵追剿，几次遭遇战都把农民军击败。他们中的一个将领叫齐进才，将首领谢汝德杀死，向清军投降；清一个将官马永爵，射死了另一个首领任一贵。三桂所属的总兵官刘芳名俘获主要首领刘登楼，当即处死。《清世祖实录》，卷46，29页。三桂占领榆林，将城中大姓尤姓、杜姓几乎全部屠杀。在清理农民军遗留的文件中，发现当地一些士大夫与姜瓖的往来书信，便按文件提供的姓名，又屠杀数十家。《庭闻录》，卷2。

　　三桂自榆林地区分兵渡过黄河，直奔陕西最北部。与山西交界的两处重要城镇，一是保德、一是府谷，这两座城正好坐落在黄河南北两岸，遥相对应。三桂部与李国翰部包围了两城，边围边攻。三桂发布招抚令，黄河东岸附近的农民军都向清军投降。何保营的“伪总兵”张凤翼被杀，在保德北部，山西境内的偏关，其守关者是叛清的万炼，由于内部发生变乱，走投无路，自焚而死。《清世祖实录》，卷46，29页。

　　这就是三桂到陕西一年多的战况，大都载入官方实录档案。但这些记载都极简略，远不如满洲将领出征与战斗情况记录的详细，也不如对孔、耿、尚战况记录的完整。而凡关于吴三桂战况的报道，多记为陕西总督、巡抚的奏报。只有个别地方采用三桂的报告。这很可能是官方修顺治实录时，不愿对一个已叛清的逆臣三桂的战功作更多更详细地反映。即使这些零碎的、很不完备的记录，也使我们看到，顺治六年，对于三桂来说，是他入陕最为紧张、充满艰险的一年。三桂自入陕，转战各地，南北驰逐无宁日，参加并指挥了大小无数次战斗，又给农民军余部和其他抗清势力以重创，基本肃清了各种抗清势力在陕西的活动。在山西那边，多尔衮曾两度亲征大同叛军，招降不成，便以武力解决，原明朝大同总兵降清的姜瓖授首，大同投降。《清世祖实录》，卷46，2页。陕西的回族起义也被“平西大将军”吞齐所率清军给镇压下去了。(蒋氏)《东华录》，卷6，101页，中华书局，1980年版。其他各处农民军余部各自为战，互不联系，因此分散了自己的力量，经不住清军集中兵力的攻击，结果都失败了。